במרכז מגדלור, בראשותו של מומחה החינוך והנפש הרב אברהם מנחם אייזנבאך שליט"א, פועל אגף חינוך מיוחד המוקדש למענה מקצועי בתחום הנחיית הורים. האגף מעניק תמיכה והכוונה למשפחות ברוכות ילדים במגזר החרדי, תוך התאמה לצרכים הייחודיים של כל משפחה, ומספק כלים ועצות מעשיות לשיפור איכות החיים ולחיזוק הקשרים המשפחתיים.